Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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NEDD8Q15843 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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NEDD8Q15843 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8Q15843 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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