Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
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NCOA1Q15788 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
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NCOA1Q15788 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
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NCOA1Q15788 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
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NCOA1Q15788 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
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NCOA1Q15788 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
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NCOA1Q15788 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
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NCOA1Q15788 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
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NCOA1Q15788 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCOA1Q15788 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NCOA1Q15788 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
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