Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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