Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms