Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK1Q15118 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms