Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms