Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
SHROOM2Q13796 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
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