Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTCH1Q13635 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
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