Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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