Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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PEX6Q13608 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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