Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATMQ13315 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATMQ13315 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATMQ13315 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATMQ13315 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATMQ13315 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATMQ13315 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATMQ13315 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATMQ13315 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATMQ13315 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATMQ13315 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATMQ13315 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATMQ13315 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATMQ13315 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATMQ13315 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATMQ13315 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATMQ13315 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATMQ13315 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATMQ13315 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATMQ13315 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATMQ13315 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATMQ13315 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATMQ13315 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATMQ13315 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATMQ13315 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATMQ13315 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATMQ13315 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATMQ13315 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATMQ13315 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATMQ13315 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATMQ13315 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATMQ13315 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATMQ13315 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ATMQ13315 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATMQ13315 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ATMQ13315 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATMQ13315 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATMQ13315 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATMQ13315 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATMQ13315 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATMQ13315 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATMQ13315 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATMQ13315 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATMQ13315 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATMQ13315 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATMQ13315 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATMQ13315 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATMQ13315 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATMQ13315 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATMQ13315 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATMQ13315 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATMQ13315 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATMQ13315 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATMQ13315 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATMQ13315 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATMQ13315 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATMQ13315 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATMQ13315 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATMQ13315 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATMQ13315 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATMQ13315 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATMQ13315 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATMQ13315 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATMQ13315 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATMQ13315 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATMQ13315 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATMQ13315 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATMQ13315 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATMQ13315 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATMQ13315 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATMQ13315 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATMQ13315 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATMQ13315 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATMQ13315 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATMQ13315 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATMQ13315 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATMQ13315 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATMQ13315 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATMQ13315 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATMQ13315 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATMQ13315 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATMQ13315 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATMQ13315 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATMQ13315 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATMQ13315 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATMQ13315 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATMQ13315 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATMQ13315 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATMQ13315 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATMQ13315 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATMQ13315 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATMQ13315 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATMQ13315 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATMQ13315 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATMQ13315 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATMQ13315 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATMQ13315 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATMQ13315 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATMQ13315 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATMQ13315 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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