Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RESTQ13127 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RESTQ13127 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RESTQ13127 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RESTQ13127 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RESTQ13127 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RESTQ13127 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RESTQ13127 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RESTQ13127 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RESTQ13127 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RESTQ13127 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RESTQ13127 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RESTQ13127 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RESTQ13127 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RESTQ13127 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RESTQ13127 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RESTQ13127 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RESTQ13127 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RESTQ13127 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RESTQ13127 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RESTQ13127 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RESTQ13127 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RESTQ13127 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RESTQ13127 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RESTQ13127 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RESTQ13127 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RESTQ13127 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RESTQ13127 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RESTQ13127 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RESTQ13127 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RESTQ13127 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RESTQ13127 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RESTQ13127 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RESTQ13127 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RESTQ13127 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RESTQ13127 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RESTQ13127 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RESTQ13127 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RESTQ13127 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RESTQ13127 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RESTQ13127 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RESTQ13127 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RESTQ13127 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RESTQ13127 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RESTQ13127 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RESTQ13127 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RESTQ13127 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RESTQ13127 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RESTQ13127 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RESTQ13127 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RESTQ13127 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RESTQ13127 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RESTQ13127 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RESTQ13127 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RESTQ13127 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RESTQ13127 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RESTQ13127 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RESTQ13127 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RESTQ13127 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RESTQ13127 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RESTQ13127 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RESTQ13127 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RESTQ13127 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RESTQ13127 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RESTQ13127 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RESTQ13127 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RESTQ13127 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RESTQ13127 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RESTQ13127 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RESTQ13127 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RESTQ13127 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RESTQ13127 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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