Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFT88Q13099 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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IFT88Q13099 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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IFT88Q13099 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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IFT88Q13099 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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IFT88Q13099 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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IFT88Q13099 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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IFT88Q13099 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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IFT88Q13099 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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IFT88Q13099 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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IFT88Q13099 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFT88Q13099 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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