Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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