Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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