Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP1Q12981 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms