Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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PTPRJQ12913 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
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PTPRJQ12913 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
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PTPRJQ12913 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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PTPRJQ12913 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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