Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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