Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOBRQ0VD83 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms