Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYCNQ0VAF6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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