Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNA1Q09470 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms