Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN5Q08AF3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms