Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4DQ08499 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DQ08499 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms