Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms