Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBQ06643 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBQ06643 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBQ06643 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBQ06643 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBQ06643 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBQ06643 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBQ06643 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBQ06643 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBQ06643 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBQ06643 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LTBQ06643 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBQ06643 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBQ06643 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBQ06643 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBQ06643 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBQ06643 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBQ06643 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBQ06643 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBQ06643 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBQ06643 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBQ06643 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBQ06643 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBQ06643 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBQ06643 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBQ06643 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBQ06643 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms