Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms