Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKCDQ05655 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms