Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPARDQ03181 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms