Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUCB1Q02818 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms