Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSG4Q00888 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms