Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms