Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX1P83916 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX1P83916 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX1P83916 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX1P83916 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX1P83916 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX1P83916 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX1P83916 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX1P83916 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX1P83916 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX1P83916 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX1P83916 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX1P83916 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX1P83916 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX1P83916 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX1P83916 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX1P83916 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX1P83916 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX1P83916 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX1P83916 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX1P83916 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX1P83916 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX1P83916 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX1P83916 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX1P83916 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX1P83916 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX1P83916 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX1P83916 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX1P83916 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX1P83916 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX1P83916 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX1P83916 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX1P83916 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX1P83916 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX1P83916 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX1P83916 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX1P83916 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX1P83916 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBX1P83916 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBX1P83916 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBX1P83916 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBX1P83916 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBX1P83916 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms