Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSBP2P81877 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms