Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRX1P78414 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRX1P78414 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRX1P78414 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRX1P78414 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRX1P78414 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRX1P78414 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRX1P78414 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRX1P78414 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRX1P78414 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRX1P78414 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRX1P78414 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
IRX1P78414 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
IRX1P78414 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRX1P78414 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRX1P78414 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRX1P78414 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRX1P78414 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRX1P78414 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRX1P78414 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRX1P78414 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRX1P78414 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRX1P78414 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRX1P78414 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRX1P78414 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRX1P78414 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRX1P78414 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRX1P78414 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRX1P78414 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRX1P78414 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRX1P78414 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRX1P78414 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRX1P78414 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRX1P78414 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRX1P78414 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRX1P78414 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRX1P78414 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IRX1P78414 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRX1P78414 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRX1P78414 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRX1P78414 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRX1P78414 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRX1P78414 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRX1P78414 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IRX1P78414 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRX1P78414 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRX1P78414 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRX1P78414 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRX1P78414 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRX1P78414 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IRX1P78414 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRX1P78414 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRX1P78414 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRX1P78414 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRX1P78414 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRX1P78414 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRX1P78414 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRX1P78414 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRX1P78414 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRX1P78414 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRX1P78414 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRX1P78414 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRX1P78414 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRX1P78414 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRX1P78414 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRX1P78414 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRX1P78414 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRX1P78414 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRX1P78414 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRX1P78414 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRX1P78414 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRX1P78414 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRX1P78414 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms