Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTG1P63261 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms