Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP1P63208 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP1P63208 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP1P63208 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP1P63208 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP1P63208 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP1P63208 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP1P63208 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP1P63208 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP1P63208 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP1P63208 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP1P63208 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP1P63208 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP1P63208 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP1P63208 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP1P63208 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP1P63208 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP1P63208 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP1P63208 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP1P63208 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP1P63208 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP1P63208 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP1P63208 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP1P63208 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP1P63208 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP1P63208 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP1P63208 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP1P63208 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP1P63208 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP1P63208 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP1P63208 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP1P63208 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP1P63208 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP1P63208 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP1P63208 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP1P63208 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKP1P63208 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKP1P63208 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP1P63208 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP1P63208 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms