Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTBP60709 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTBP60709 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTBP60709 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTBP60709 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTBP60709 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTBP60709 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTBP60709 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTBP60709 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTBP60709 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTBP60709 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTBP60709 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTBP60709 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTBP60709 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTBP60709 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTBP60709 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTBP60709 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTBP60709 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTBP60709 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTBP60709 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTBP60709 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTBP60709 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTBP60709 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTBP60709 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTBP60709 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTBP60709 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTBP60709 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTBP60709 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTBP60709 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTBP60709 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTBP60709 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTBP60709 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTBP60709 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTBP60709 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTBP60709 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTBP60709 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTBP60709 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTBP60709 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTBP60709 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms