Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms