Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms