Protein–RNA interactions for Protein: P56470

LGALS4, Galectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS4P56470 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS4P56470 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS4P56470 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LGALS4P56470 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LGALS4P56470 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS4P56470 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms