Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AQP4P55087 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AQP4P55087 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AQP4P55087 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AQP4P55087 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AQP4P55087 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AQP4P55087 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AQP4P55087 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AQP4P55087 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AQP4P55087 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AQP4P55087 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AQP4P55087 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AQP4P55087 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AQP4P55087 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AQP4P55087 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AQP4P55087 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AQP4P55087 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AQP4P55087 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AQP4P55087 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AQP4P55087 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AQP4P55087 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AQP4P55087 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AQP4P55087 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AQP4P55087 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AQP4P55087 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AQP4P55087 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AQP4P55087 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AQP4P55087 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AQP4P55087 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AQP4P55087 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AQP4P55087 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AQP4P55087 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AQP4P55087 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms