Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms