Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms