Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFNA4P52798 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms