Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms