Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms