Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPFP49454 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPFP49454 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPFP49454 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPFP49454 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPFP49454 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPFP49454 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPFP49454 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPFP49454 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPFP49454 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPFP49454 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPFP49454 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPFP49454 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPFP49454 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPFP49454 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPFP49454 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPFP49454 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPFP49454 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPFP49454 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPFP49454 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPFP49454 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPFP49454 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPFP49454 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPFP49454 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPFP49454 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPFP49454 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPFP49454 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPFP49454 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPFP49454 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPFP49454 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPFP49454 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPFP49454 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPFP49454 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPFP49454 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPFP49454 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPFP49454 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPFP49454 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPFP49454 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPFP49454 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPFP49454 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPFP49454 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPFP49454 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPFP49454 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPFP49454 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPFP49454 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPFP49454 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPFP49454 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPFP49454 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPFP49454 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPFP49454 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPFP49454 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPFP49454 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPFP49454 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPFP49454 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPFP49454 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPFP49454 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPFP49454 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPFP49454 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPFP49454 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPFP49454 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPFP49454 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPFP49454 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPFP49454 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPFP49454 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPFP49454 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPFP49454 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPFP49454 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPFP49454 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPFP49454 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPFP49454 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPFP49454 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPFP49454 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPFP49454 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPFP49454 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPFP49454 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPFP49454 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPFP49454 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPFP49454 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPFP49454 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPFP49454 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPFP49454 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPFP49454 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPFP49454 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPFP49454 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPFP49454 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPFP49454 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPFP49454 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPFP49454 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPFP49454 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPFP49454 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPFP49454 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPFP49454 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPFP49454 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPFP49454 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPFP49454 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPFP49454 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPFP49454 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPFP49454 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPFP49454 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPFP49454 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms