Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTBP49356 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTBP49356 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTBP49356 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTBP49356 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTBP49356 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTBP49356 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTBP49356 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTBP49356 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTBP49356 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTBP49356 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTBP49356 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTBP49356 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTBP49356 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTBP49356 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTBP49356 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTBP49356 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTBP49356 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTBP49356 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTBP49356 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTBP49356 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTBP49356 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTBP49356 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTBP49356 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTBP49356 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTBP49356 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTBP49356 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTBP49356 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTBP49356 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTBP49356 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTBP49356 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTBP49356 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTBP49356 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTBP49356 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTBP49356 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTBP49356 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTBP49356 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTBP49356 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTBP49356 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTBP49356 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTBP49356 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTBP49356 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTBP49356 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTBP49356 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTBP49356 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTBP49356 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FNTBP49356 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FNTBP49356 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
FNTBP49356 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FNTBP49356 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTBP49356 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms