Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A3P48751 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms