Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLMP48507 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLMP48507 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GCLMP48507 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
GCLMP48507 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLMP48507 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLMP48507 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLMP48507 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLMP48507 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLMP48507 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLMP48507 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLMP48507 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLMP48507 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLMP48507 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLMP48507 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLMP48507 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLMP48507 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLMP48507 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLMP48507 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLMP48507 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLMP48507 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLMP48507 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLMP48507 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLMP48507 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLMP48507 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCLMP48507 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLMP48507 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLMP48507 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLMP48507 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLMP48507 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLMP48507 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLMP48507 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLMP48507 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLMP48507 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLMP48507 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLMP48507 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLMP48507 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLMP48507 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLMP48507 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLMP48507 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLMP48507 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLMP48507 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLMP48507 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLMP48507 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLMP48507 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLMP48507 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLMP48507 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLMP48507 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCLMP48507 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLMP48507 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLMP48507 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLMP48507 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLMP48507 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLMP48507 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLMP48507 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLMP48507 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLMP48507 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLMP48507 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLMP48507 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLMP48507 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLMP48507 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLMP48507 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLMP48507 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLMP48507 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLMP48507 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLMP48507 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLMP48507 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLMP48507 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCLMP48507 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLMP48507 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLMP48507 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLMP48507 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLMP48507 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLMP48507 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLMP48507 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLMP48507 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLMP48507 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLMP48507 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLMP48507 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLMP48507 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLMP48507 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLMP48507 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLMP48507 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLMP48507 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLMP48507 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLMP48507 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLMP48507 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLMP48507 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCLMP48507 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCLMP48507 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCLMP48507 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCLMP48507 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCLMP48507 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCLMP48507 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCLMP48507 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCLMP48507 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCLMP48507 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCLMP48507 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCLMP48507 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCLMP48507 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms